El proyecto AMIGA tiene como objetivo ampliar el rango de detección de Auger, para observar rayos cósmicos de energías menores, para estudiar la transición de rayos cósmicos galácticos (de más baja energía) a extragalácticos (de más alta energía).

El proyecto AMIGA se basa en la instalación y operación de contadores de muones. Los muones son partículas elementales, abundantes en las cascadas atmosféricas, que tienen gran poder de penetración en la materia. Por ello, los contadores de muones de AMIGA están enterrados a 2,3 m bajo tierra, para detectar solamente la componente muonica de la lluvia de partículas.

Cada uno de los contadores de muones está formado por 64 centelladores plásticos, un PMT multi-píxel y electrónica de adquisición que trabajará en conjunto con el detector de superficie del Observatorio Pierre Auger.